El nucleoplasma es la porción del citoplasma rodeada de la membrana nuclear, constituido por gránulos de cromatina, partículas de ribonucleoproteínas y matriz nuclear. Desde el punto de vista bioquímico, esta última contiene en torno al 10% de proteínas totales, 30% del RNA, 1-3% del DNA y 2-5% de todo el fosfato nuclear total.

El nucleolo es una estructura densa localizada en el nucleoplasma, que suele aparecer a razón de dos o tres por célula, aunque eso dependerá del tipo celular y de la actividad de ésta. Se observa sólo durante la interfase porque desaparece durante la división celular. Es rico en RNA y proteínas, y contiene pequeñas cantidades de DNA que se muestra inactivo. Se han descrito cuatro regiones definidas en el nucleolo:

• el centro fibrilar, que contienen el DNA inactivo (que no está transcribiendo), además de las llamadas regiones organizadoras nucleolares, en las que se encuentran genes ribosomales que son los que codifican el RNA ribosomal
  
• la parte fibrosa, que contiene los RNA nucleolares que se están transcribiendo
  
• la parte granulosa, en la que se ensamblan las subunidades ribosomales que están madurando
  
• la matriz nucleolar, formada por una red de fibras que participan en la organización del nucleolo

Al final, desde el nucleolo a través de los poros nucleares salen las partículas de ribonucleoproteínas hacia el citoplasma, donde tiene lugar la maduración definitiva del ribosoma.