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La inclusión
de archivos de coordenadas moleculares en una página web no presenta
grandes dificultades si se tiene cierta experiencia en elaborar estas
páginas.
La creación de estas páginas hipertextuales
puede hacerse con un simple editor de textos como el EDIT del Sistema Operativo
MS-DOS, el Bloc de Notas de Accesorios de Windows 95/98 o el Simple Text
del entorno Macintosh, ya que las páginas HTML son ficheros de "texto
sencillo" (texto ASCII). También se pueden utilizar programas editores
de páginas Web que tienen la capacidad de crear sofisticados documentos
web sin necesidad de conocer en profundidad el lenguaje HTML.
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Para introducir
en las páginas HTML archivos moleculares se utiliza el comando/la
etiqueta/tag "EMBED", que tiene una sintaxis básica similar al de
inserción de una imagen. La estructura básica de la etiqueta
es:
<embed src="molecula.pdb">
Donde "molecula.pdb" es el nombre del fichero de coordenadas
moleculares que se quiere visualizar. Lógicamente, si este fichero
no se encuentra en la misma carpeta que la página HTML se tiene
que especificar la ruta.
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La etiqueta
"embed" con ficheros de formatos de coordenadas moleculares presenta además
unos parámetros propios, con los que se pueden indicar distintas
opciones de representación como dimensiones de la ventana donde
aparece el modelo molecular, y el tipo de modelo molecular representado.
Cuando no se indican ninguno de estos parámetros en la etiqueta,
las opciones tienen los valores por defecto.
A continuación vamos a mostrar distintas opciones
básicas de presentación de los modelos moleculares en una
página web y los parámetros utilizados.
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